Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RGPD2P0DJD1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RGPD2P0DJD1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RGPD2P0DJD1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
RGPD2P0DJD1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RGPD2P0DJD1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RGPD2P0DJD1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RGPD2P0DJD1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RGPD2P0DJD1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RGPD2P0DJD1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RGPD2P0DJD1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RGPD2P0DJD1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
RGPD2P0DJD1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RGPD2P0DJD1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RGPD2P0DJD1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RGPD2P0DJD1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RGPD2P0DJD1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RGPD2P0DJD1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RGPD2P0DJD1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RGPD2P0DJD1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RGPD2P0DJD1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RGPD2P0DJD1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RGPD2P0DJD1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RGPD2P0DJD1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RGPD2P0DJD1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RGPD2P0DJD1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RGPD2P0DJD1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RGPD2P0DJD1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RGPD2P0DJD1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
RGPD2P0DJD1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RGPD2P0DJD1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RGPD2P0DJD1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
RGPD2P0DJD1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
RGPD2P0DJD1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RGPD2P0DJD1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RGPD2P0DJD1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RGPD2P0DJD1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RGPD2P0DJD1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RGPD2P0DJD1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RGPD2P0DJD1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
RGPD2P0DJD1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RGPD2P0DJD1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RGPD2P0DJD1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RGPD2P0DJD1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RGPD2P0DJD1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RGPD2P0DJD1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RGPD2P0DJD1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RGPD2P0DJD1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RGPD2P0DJD1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RGPD2P0DJD1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RGPD2P0DJD1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RGPD2P0DJD1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RGPD2P0DJD1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RGPD2P0DJD1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RGPD2P0DJD1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RGPD2P0DJD1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
RGPD2P0DJD1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
RGPD2P0DJD1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RGPD2P0DJD1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
RGPD2P0DJD1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
RGPD2P0DJD1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
RGPD2P0DJD1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
RGPD2P0DJD1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
RGPD2P0DJD1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.7 ms