Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC41.61■■■■■ 4.25
POLA1P09884 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
POLA1P09884 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
POLA1P09884 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.61■■■■■ 4.25
POLA1P09884 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC41.6■■■■■ 4.25
POLA1P09884 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
POLA1P09884 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
POLA1P09884 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
POLA1P09884 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
POLA1P09884 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
POLA1P09884 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
POLA1P09884 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
POLA1P09884 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
POLA1P09884 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
POLA1P09884 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
POLA1P09884 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.24
POLA1P09884 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
POLA1P09884 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
POLA1P09884 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
POLA1P09884 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
POLA1P09884 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
POLA1P09884 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
POLA1P09884 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
POLA1P09884 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
POLA1P09884 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
POLA1P09884 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
POLA1P09884 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
POLA1P09884 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
POLA1P09884 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
POLA1P09884 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
POLA1P09884 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
POLA1P09884 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
POLA1P09884 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
POLA1P09884 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC41.51■■■■■ 4.24
POLA1P09884 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
POLA1P09884 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
POLA1P09884 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
POLA1P09884 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
POLA1P09884 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
POLA1P09884 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC41.49■■■■■ 4.23
POLA1P09884 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC41.48■■■■■ 4.23
POLA1P09884 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
POLA1P09884 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
POLA1P09884 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
POLA1P09884 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
POLA1P09884 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
POLA1P09884 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
POLA1P09884 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC41.47■■■■■ 4.23
POLA1P09884 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
POLA1P09884 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
POLA1P09884 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
POLA1P09884 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
POLA1P09884 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
POLA1P09884 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
POLA1P09884 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
POLA1P09884 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
POLA1P09884 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.44■■■■■ 4.22
POLA1P09884 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
POLA1P09884 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
POLA1P09884 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC41.43■■■■■ 4.22
POLA1P09884 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC41.43■■■■■ 4.22
POLA1P09884 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
POLA1P09884 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC41.42■■■■■ 4.22
POLA1P09884 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
POLA1P09884 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
POLA1P09884 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
POLA1P09884 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
POLA1P09884 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
POLA1P09884 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
POLA1P09884 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
POLA1P09884 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
POLA1P09884 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
POLA1P09884 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
POLA1P09884 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
POLA1P09884 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
POLA1P09884 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
POLA1P09884 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC41.39■■■■■ 4.22
POLA1P09884 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
POLA1P09884 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
POLA1P09884 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
POLA1P09884 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC41.38■■■■■ 4.21
POLA1P09884 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
POLA1P09884 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC41.38■■■■■ 4.21
POLA1P09884 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
POLA1P09884 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
POLA1P09884 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC41.37■■■■■ 4.21
POLA1P09884 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
POLA1P09884 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
POLA1P09884 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
POLA1P09884 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
POLA1P09884 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
POLA1P09884 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
POLA1P09884 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
POLA1P09884 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
POLA1P09884 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
POLA1P09884 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
POLA1P09884 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
POLA1P09884 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
POLA1P09884 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC41.34■■■■■ 4.21
POLA1P09884 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms