Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC4P09017 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC4P09017 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC4P09017 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms