Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRM2P04554 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRM2P04554 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRM2P04554 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRM2P04554 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRM2P04554 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRM2P04554 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRM2P04554 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRM2P04554 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRM2P04554 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRM2P04554 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRM2P04554 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRM2P04554 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRM2P04554 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRM2P04554 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRM2P04554 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRM2P04554 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRM2P04554 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRM2P04554 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRM2P04554 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRM2P04554 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRM2P04554 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRM2P04554 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRM2P04554 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRM2P04554 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRM2P04554 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRM2P04554 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRM2P04554 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PRM2P04554 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRM2P04554 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRM2P04554 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRM2P04554 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PRM2P04554 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PRM2P04554 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRM2P04554 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRM2P04554 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRM2P04554 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRM2P04554 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRM2P04554 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRM2P04554 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRM2P04554 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRM2P04554 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRM2P04554 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRM2P04554 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRM2P04554 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRM2P04554 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRM2P04554 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PRM2P04554 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRM2P04554 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRM2P04554 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRM2P04554 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRM2P04554 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRM2P04554 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRM2P04554 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRM2P04554 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRM2P04554 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRM2P04554 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRM2P04554 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRM2P04554 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRM2P04554 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRM2P04554 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PRM2P04554 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PRM2P04554 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRM2P04554 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRM2P04554 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRM2P04554 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PRM2P04554 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRM2P04554 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRM2P04554 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRM2P04554 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRM2P04554 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRM2P04554 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRM2P04554 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRM2P04554 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRM2P04554 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRM2P04554 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRM2P04554 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRM2P04554 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRM2P04554 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRM2P04554 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRM2P04554 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRM2P04554 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRM2P04554 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRM2P04554 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRM2P04554 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRM2P04554 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRM2P04554 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRM2P04554 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRM2P04554 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRM2P04554 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRM2P04554 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRM2P04554 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRM2P04554 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PRM2P04554 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRM2P04554 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRM2P04554 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRM2P04554 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRM2P04554 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRM2P04554 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRM2P04554 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms