Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYF2O95926 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYF2O95926 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYF2O95926 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYF2O95926 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYF2O95926 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYF2O95926 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYF2O95926 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYF2O95926 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYF2O95926 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYF2O95926 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYF2O95926 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYF2O95926 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYF2O95926 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYF2O95926 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYF2O95926 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYF2O95926 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYF2O95926 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYF2O95926 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYF2O95926 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYF2O95926 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYF2O95926 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYF2O95926 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYF2O95926 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYF2O95926 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYF2O95926 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYF2O95926 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYF2O95926 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYF2O95926 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYF2O95926 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYF2O95926 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYF2O95926 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYF2O95926 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYF2O95926 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYF2O95926 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYF2O95926 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYF2O95926 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYF2O95926 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYF2O95926 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYF2O95926 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYF2O95926 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYF2O95926 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYF2O95926 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYF2O95926 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYF2O95926 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYF2O95926 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYF2O95926 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYF2O95926 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYF2O95926 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYF2O95926 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYF2O95926 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SYF2O95926 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYF2O95926 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYF2O95926 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYF2O95926 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYF2O95926 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYF2O95926 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYF2O95926 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYF2O95926 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYF2O95926 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYF2O95926 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYF2O95926 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYF2O95926 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYF2O95926 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYF2O95926 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYF2O95926 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYF2O95926 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SYF2O95926 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYF2O95926 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SYF2O95926 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYF2O95926 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYF2O95926 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYF2O95926 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYF2O95926 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SYF2O95926 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYF2O95926 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SYF2O95926 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYF2O95926 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYF2O95926 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SYF2O95926 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYF2O95926 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYF2O95926 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYF2O95926 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYF2O95926 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SYF2O95926 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SYF2O95926 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SYF2O95926 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYF2O95926 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYF2O95926 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SYF2O95926 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SYF2O95926 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYF2O95926 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYF2O95926 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SYF2O95926 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYF2O95926 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYF2O95926 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYF2O95926 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYF2O95926 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYF2O95926 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SYF2O95926 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms