Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SEC24AO95486 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SEC24AO95486 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEC24AO95486 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms