Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL18O94889 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL18O94889 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL18O94889 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL18O94889 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL18O94889 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL18O94889 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL18O94889 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL18O94889 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL18O94889 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL18O94889 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL18O94889 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL18O94889 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL18O94889 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL18O94889 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL18O94889 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL18O94889 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL18O94889 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL18O94889 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL18O94889 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL18O94889 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL18O94889 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL18O94889 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL18O94889 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL18O94889 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KLHL18O94889 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL18O94889 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KLHL18O94889 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL18O94889 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL18O94889 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms