Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DYSFO75923 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DYSFO75923 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DYSFO75923 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DYSFO75923 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DYSFO75923 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DYSFO75923 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DYSFO75923 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DYSFO75923 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DYSFO75923 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DYSFO75923 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DYSFO75923 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DYSFO75923 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DYSFO75923 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DYSFO75923 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DYSFO75923 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DYSFO75923 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DYSFO75923 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DYSFO75923 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DYSFO75923 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DYSFO75923 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DYSFO75923 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DYSFO75923 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DYSFO75923 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DYSFO75923 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DYSFO75923 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DYSFO75923 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DYSFO75923 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DYSFO75923 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DYSFO75923 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DYSFO75923 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DYSFO75923 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DYSFO75923 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DYSFO75923 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DYSFO75923 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DYSFO75923 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DYSFO75923 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DYSFO75923 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DYSFO75923 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DYSFO75923 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DYSFO75923 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DYSFO75923 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DYSFO75923 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DYSFO75923 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DYSFO75923 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DYSFO75923 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DYSFO75923 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DYSFO75923 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DYSFO75923 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DYSFO75923 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DYSFO75923 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DYSFO75923 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DYSFO75923 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DYSFO75923 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DYSFO75923 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DYSFO75923 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DYSFO75923 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DYSFO75923 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DYSFO75923 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DYSFO75923 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DYSFO75923 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DYSFO75923 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DYSFO75923 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DYSFO75923 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DYSFO75923 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DYSFO75923 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DYSFO75923 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DYSFO75923 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DYSFO75923 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DYSFO75923 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DYSFO75923 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DYSFO75923 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DYSFO75923 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DYSFO75923 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DYSFO75923 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DYSFO75923 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DYSFO75923 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DYSFO75923 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DYSFO75923 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DYSFO75923 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DYSFO75923 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DYSFO75923 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DYSFO75923 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DYSFO75923 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DYSFO75923 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DYSFO75923 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DYSFO75923 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DYSFO75923 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DYSFO75923 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DYSFO75923 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DYSFO75923 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DYSFO75923 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DYSFO75923 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DYSFO75923 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DYSFO75923 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DYSFO75923 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DYSFO75923 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DYSFO75923 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DYSFO75923 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DYSFO75923 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms