Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPFIA4O75335 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPFIA4O75335 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PPFIA4O75335 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPFIA4O75335 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPFIA4O75335 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIA4O75335 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2578.4 ms