Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG13O75143 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG13O75143 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG13O75143 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG13O75143 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG13O75143 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG13O75143 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG13O75143 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG13O75143 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG13O75143 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG13O75143 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG13O75143 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG13O75143 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG13O75143 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG13O75143 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG13O75143 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG13O75143 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG13O75143 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG13O75143 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG13O75143 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG13O75143 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG13O75143 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG13O75143 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG13O75143 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG13O75143 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG13O75143 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG13O75143 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG13O75143 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG13O75143 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG13O75143 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG13O75143 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG13O75143 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG13O75143 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG13O75143 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG13O75143 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG13O75143 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG13O75143 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG13O75143 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG13O75143 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG13O75143 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG13O75143 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG13O75143 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG13O75143 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG13O75143 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG13O75143 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG13O75143 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG13O75143 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG13O75143 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG13O75143 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG13O75143 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG13O75143 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG13O75143 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG13O75143 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG13O75143 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG13O75143 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG13O75143 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG13O75143 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG13O75143 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG13O75143 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG13O75143 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG13O75143 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG13O75143 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG13O75143 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG13O75143 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG13O75143 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ATG13O75143 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATG13O75143 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ATG13O75143 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG13O75143 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG13O75143 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATG13O75143 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG13O75143 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG13O75143 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG13O75143 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG13O75143 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATG13O75143 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG13O75143 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG13O75143 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG13O75143 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG13O75143 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG13O75143 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG13O75143 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG13O75143 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG13O75143 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG13O75143 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG13O75143 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG13O75143 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG13O75143 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG13O75143 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG13O75143 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG13O75143 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG13O75143 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG13O75143 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG13O75143 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG13O75143 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG13O75143 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG13O75143 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG13O75143 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATG13O75143 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG13O75143 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms