Protein–RNA interactions for Protein: O60575

SPINK4, Serine protease inhibitor Kazal-type 4, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK4O60575 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPINK4O60575 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPINK4O60575 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms