Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SYNGR2O43760 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYNGR2O43760 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYNGR2O43760 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms