Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA2O43364 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA2O43364 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOXA2O43364 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOXA2O43364 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOXA2O43364 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms