Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GOLGA8SH3BPF8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GOLGA8SH3BPF8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GOLGA8SH3BPF8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GOLGA8SH3BPF8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA8SH3BPF8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA8SH3BPF8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA8SH3BPF8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms