Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
B4E171 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
B4E171 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
B4E171 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
B4E171 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
B4E171 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
B4E171 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B4E171 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B4E171 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B4E171 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B4E171 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
B4E171 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B4E171 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B4E171 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B4E171 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B4E171 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
B4E171 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B4E171 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B4E171 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B4E171 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B4E171 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
B4E171 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B4E171 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
B4E171 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
B4E171 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
B4E171 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
B4E171 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
B4E171 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
B4E171 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
B4E171 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
B4E171 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
B4E171 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
B4E171 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
B4E171 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
B4E171 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
B4E171 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
B4E171 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
B4E171 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
B4E171 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
B4E171 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
B4E171 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
B4E171 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
B4E171 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
B4E171 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
B4E171 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
B4E171 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
B4E171 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
B4E171 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
B4E171 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
B4E171 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
B4E171 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
B4E171 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
B4E171 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
B4E171 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
B4E171 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
B4E171 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
B4E171 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
B4E171 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
B4E171 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
B4E171 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
B4E171 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
B4E171 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
B4E171 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
B4E171 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
B4E171 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
B4E171 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
B4E171 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B4E171 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B4E171 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B4E171 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
B4E171 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
B4E171 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
B4E171 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B4E171 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
B4E171 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B4E171 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B4E171 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
B4E171 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B4E171 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
B4E171 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
B4E171 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
B4E171 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
B4E171 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
B4E171 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
B4E171 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
B4E171 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
B4E171 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4E171 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4E171 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4E171 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4E171 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4E171 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4E171 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4E171 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4E171 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4E171 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4E171 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4E171 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4E171 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4E171 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms