Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PSDA5PKW4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PSDA5PKW4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PSDA5PKW4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PSDA5PKW4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PSDA5PKW4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PSDA5PKW4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PSDA5PKW4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PSDA5PKW4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PSDA5PKW4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PSDA5PKW4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PSDA5PKW4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PSDA5PKW4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PSDA5PKW4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PSDA5PKW4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PSDA5PKW4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PSDA5PKW4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PSDA5PKW4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PSDA5PKW4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PSDA5PKW4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PSDA5PKW4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PSDA5PKW4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PSDA5PKW4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PSDA5PKW4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
PSDA5PKW4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PSDA5PKW4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PSDA5PKW4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PSDA5PKW4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PSDA5PKW4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PSDA5PKW4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PSDA5PKW4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PSDA5PKW4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PSDA5PKW4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PSDA5PKW4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PSDA5PKW4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PSDA5PKW4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PSDA5PKW4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
PSDA5PKW4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PSDA5PKW4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PSDA5PKW4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PSDA5PKW4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PSDA5PKW4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PSDA5PKW4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PSDA5PKW4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
PSDA5PKW4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PSDA5PKW4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PSDA5PKW4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PSDA5PKW4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PSDA5PKW4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PSDA5PKW4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PSDA5PKW4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
PSDA5PKW4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PSDA5PKW4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PSDA5PKW4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PSDA5PKW4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
PSDA5PKW4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PSDA5PKW4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PSDA5PKW4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PSDA5PKW4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PSDA5PKW4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PSDA5PKW4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PSDA5PKW4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PSDA5PKW4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PSDA5PKW4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PSDA5PKW4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PSDA5PKW4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PSDA5PKW4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PSDA5PKW4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PSDA5PKW4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
PSDA5PKW4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PSDA5PKW4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PSDA5PKW4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PSDA5PKW4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PSDA5PKW4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PSDA5PKW4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
PSDA5PKW4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PSDA5PKW4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PSDA5PKW4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PSDA5PKW4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PSDA5PKW4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PSDA5PKW4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PSDA5PKW4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PSDA5PKW4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PSDA5PKW4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PSDA5PKW4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PSDA5PKW4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PSDA5PKW4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
PSDA5PKW4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
PSDA5PKW4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
PSDA5PKW4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PSDA5PKW4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PSDA5PKW4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PSDA5PKW4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PSDA5PKW4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PSDA5PKW4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PSDA5PKW4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PSDA5PKW4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PSDA5PKW4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PSDA5PKW4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PSDA5PKW4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms