Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SSPOA2VEC9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SSPOA2VEC9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms