Protein–RNA interactions for Protein: A0PK05

TMEM72, Transmembrane protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM72A0PK05 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM72A0PK05 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM72A0PK05 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM72A0PK05 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms