Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GFRA4Q9GZZ7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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