Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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SNCBQ16143 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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SNCBQ16143 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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SNCBQ16143 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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SNCBQ16143 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SNCBQ16143 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SNCBQ16143 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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