Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SNCBQ16143 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SNCBQ16143 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SNCBQ16143 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SNCBQ16143 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SNCBQ16143 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SNCBQ16143 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SNCBQ16143 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SNCBQ16143 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SNCBQ16143 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SNCBQ16143 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SNCBQ16143 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SNCBQ16143 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SNCBQ16143 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SNCBQ16143 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SNCBQ16143 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SNCBQ16143 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SNCBQ16143 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SNCBQ16143 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SNCBQ16143 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SNCBQ16143 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SNCBQ16143 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SNCBQ16143 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SNCBQ16143 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SNCBQ16143 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SNCBQ16143 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SNCBQ16143 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SNCBQ16143 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SNCBQ16143 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SNCBQ16143 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SNCBQ16143 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SNCBQ16143 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SNCBQ16143 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SNCBQ16143 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SNCBQ16143 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SNCBQ16143 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SNCBQ16143 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SNCBQ16143 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SNCBQ16143 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SNCBQ16143 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SNCBQ16143 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SNCBQ16143 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNCBQ16143 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SNCBQ16143 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SNCBQ16143 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SNCBQ16143 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SNCBQ16143 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SNCBQ16143 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNCBQ16143 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNCBQ16143 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNCBQ16143 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SNCBQ16143 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SNCBQ16143 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SNCBQ16143 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SNCBQ16143 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SNCBQ16143 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SNCBQ16143 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SNCBQ16143 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNCBQ16143 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNCBQ16143 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SNCBQ16143 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SNCBQ16143 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SNCBQ16143 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNCBQ16143 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SNCBQ16143 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SNCBQ16143 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SNCBQ16143 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNCBQ16143 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNCBQ16143 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNCBQ16143 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SNCBQ16143 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNCBQ16143 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SNCBQ16143 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SNCBQ16143 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SNCBQ16143 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNCBQ16143 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNCBQ16143 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNCBQ16143 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNCBQ16143 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SNCBQ16143 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNCBQ16143 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNCBQ16143 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNCBQ16143 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNCBQ16143 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNCBQ16143 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNCBQ16143 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNCBQ16143 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNCBQ16143 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNCBQ16143 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNCBQ16143 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNCBQ16143 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNCBQ16143 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNCBQ16143 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNCBQ16143 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNCBQ16143 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNCBQ16143 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNCBQ16143 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SNCBQ16143 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNCBQ16143 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNCBQ16143 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
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