Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RORCP51449 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RORCP51449 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RORCP51449 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RORCP51449 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RORCP51449 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RORCP51449 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RORCP51449 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RORCP51449 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RORCP51449 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RORCP51449 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RORCP51449 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RORCP51449 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RORCP51449 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RORCP51449 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RORCP51449 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RORCP51449 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RORCP51449 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RORCP51449 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms