RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311101.9

PARL-201, Transcript of presenilin associated rhomboid like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PARL, Length 1,240 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARL-201ENST00000311101 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.67■■■■■ 5.38
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PARL-201ENST00000311101 ABCC9O60706 1549 aa42.87■■■■■ 4.45
PARL-201ENST00000311101 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.86■■■■■ 4.13
PARL-201ENST00000311101 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.76■■■■■ 4.12
PARL-201ENST00000311101 NACADO15069 1562 aa40.75■■■■■ 4.11
PARL-201ENST00000311101 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
PARL-201ENST00000311101 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.44■■■■■ 4.06
PARL-201ENST00000311101 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.21■■■■■ 4.03
PARL-201ENST00000311101 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.06■■■■■ 4
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PARL-201ENST00000311101 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.71■■■■□ 3.95
PARL-201ENST00000311101 SCRIBQ14160 1630 aa39.55■■■■□ 3.92
PARL-201ENST00000311101 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.13■■■■□ 3.85
PARL-201ENST00000311101 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.74■■■■□ 3.79
PARL-201ENST00000311101 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.7■■■■□ 3.79
PARL-201ENST00000311101 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.55■■■■□ 3.76
PARL-201ENST00000311101 SMARCA4P51532 1647 aa37.79■■■■□ 3.64
PARL-201ENST00000311101 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.71■■■■□ 3.63
PARL-201ENST00000311101 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.64■■■■□ 3.62
PARL-201ENST00000311101 NCAPD3P42695 1498 aa37.64■■■■□ 3.62
PARL-201ENST00000311101 SMARCA2P51531 1590 aa37.55■■■■□ 3.6
PARL-201ENST00000311101 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.55■■■■□ 3.6
PARL-201ENST00000311101 HMGXB3Q12766 1538 aa37.41■■■■□ 3.58
PARL-201ENST00000311101 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.41■■■■□ 3.58
PARL-201ENST00000311101 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
PARL-201ENST00000311101 WIZO95785 1651 aa37.12■■■■□ 3.53
PARL-201ENST00000311101 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
PARL-201ENST00000311101 ERCC6Q03468 1493 aa36.97■■■■□ 3.51
PARL-201ENST00000311101 NESP48681 1621 aa36.91■■■■□ 3.5
PARL-201ENST00000311101 CUX2O14529 1486 aa36.77■■■■□ 3.48
PARL-201ENST00000311101 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
PARL-201ENST00000311101 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.63■■■■□ 3.45
PARL-201ENST00000311101 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.53■■■■□ 3.44
PARL-201ENST00000311101 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
PARL-201ENST00000311101 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.49■■■■□ 3.43
PARL-201ENST00000311101 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.45■■■■□ 3.43
PARL-201ENST00000311101 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.4■■■■□ 3.42
PARL-201ENST00000311101 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.29■■■■□ 3.4
PARL-201ENST00000311101 CFTRP13569 1480 aa36.28■■■■□ 3.4
PARL-201ENST00000311101 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.12■■■■□ 3.37
PARL-201ENST00000311101 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.09■■■■□ 3.37
PARL-201ENST00000311101 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.07■■■■□ 3.37
PARL-201ENST00000311101 WDR62O43379 1518 aa36■■■■□ 3.35
PARL-201ENST00000311101 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
PARL-201ENST00000311101 PRDM2Q13029 1718 aa35.93■■■■□ 3.34
PARL-201ENST00000311101 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
PARL-201ENST00000311101 TOPBP1Q92547 1522 aa35.53■■■■□ 3.28
PARL-201ENST00000311101 ABCC8Q09428 1581 aa35.45■■■■□ 3.27
PARL-201ENST00000311101 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.45■■■■□ 3.27
PARL-201ENST00000311101 IFT140Q96RY7 1462 aa35.32■■■■□ 3.24
PARL-201ENST00000311101 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
PARL-201ENST00000311101 CUX1P39880 1505 aa35.22■■■■□ 3.23
PARL-201ENST00000311101 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
PARL-201ENST00000311101 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
PARL-201ENST00000311101 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.11■■■■□ 3.21
PARL-201ENST00000311101 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.1■■■■□ 3.21
PARL-201ENST00000311101 OSCARQ8IYS5 282 aa35.1■■■■□ 3.21
PARL-201ENST00000311101 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
PARL-201ENST00000311101 SOGA1O94964 1423 aa35.06■■■■□ 3.2
PARL-201ENST00000311101 TRIM41Q8WV44 630 aa35.05■■■■□ 3.2
PARL-201ENST00000311101 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.01■■■■□ 3.19
PARL-201ENST00000311101 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
PARL-201ENST00000311101 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.9■■■■□ 3.18
PARL-201ENST00000311101 SYNJ1O43426 1573 aa34.86■■■■□ 3.17
PARL-201ENST00000311101 TOP2BQ02880 1626 aa34.84■■■■□ 3.17
PARL-201ENST00000311101 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.83■■■■□ 3.17
PARL-201ENST00000311101 WDR97A6NE52 1622 aa34.81■■■■□ 3.16
PARL-201ENST00000311101 CHD1O14646 1710 aa34.8■■■■□ 3.16
PARL-201ENST00000311101 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.75■■■■□ 3.15
PARL-201ENST00000311101 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.74■■■■□ 3.15
PARL-201ENST00000311101 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.74■■■■□ 3.15
PARL-201ENST00000311101 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.74■■■■□ 3.15
PARL-201ENST00000311101 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.66■■■■□ 3.14
PARL-201ENST00000311101 GRIN2BQ13224 1484 aa34.65■■■■□ 3.14
PARL-201ENST00000311101 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.65■■■■□ 3.14
PARL-201ENST00000311101 FBLN2P98095 1184 aa34.63■■■■□ 3.13
PARL-201ENST00000311101 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.63■■■■□ 3.13
PARL-201ENST00000311101 ARHGEF11O15085 1522 aa34.62■■■■□ 3.13
PARL-201ENST00000311101 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
PARL-201ENST00000311101 PBRM1Q86U86 1689 aa34.57■■■■□ 3.12
PARL-201ENST00000311101 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.11
PARL-201ENST00000311101 SYNJ2O15056 1496 aa34.45■■■■□ 3.1
PARL-201ENST00000311101 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.34■■■■□ 3.09
PARL-201ENST00000311101 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.31■■■■□ 3.08
PARL-201ENST00000311101 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.31■■■■□ 3.08
PARL-201ENST00000311101 ARAP1Q96P48 1450 aa34.31■■■■□ 3.08
PARL-201ENST00000311101 ADAMTS12P58397 1594 aa34.31■■■■□ 3.08
PARL-201ENST00000311101 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.24■■■■□ 3.07
PARL-201ENST00000311101 GRIN2AQ12879 1464 aa34.23■■■■□ 3.07
PARL-201ENST00000311101 KIF27Q86VH2 1401 aa34.17■■■■□ 3.06
PARL-201ENST00000311101 IGF1RP08069 1367 aa34.1■■■■□ 3.05
PARL-201ENST00000311101 NUP160Q12769 1436 aa34.09■■■■□ 3.05
PARL-201ENST00000311101 CEP170Q5SW79 1584 aa34.08■■■■□ 3.05
PARL-201ENST00000311101 CUL7Q14999 1698 aa33.95■■■■□ 3.03
PARL-201ENST00000311101 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.89■■■■□ 3.02
PARL-201ENST00000311101 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.88■■■■□ 3.01
PARL-201ENST00000311101 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.88■■■■□ 3.01
PARL-201ENST00000311101 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
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