Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMB3Q13751 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LAMB3Q13751 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms