Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD83Q01151 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD83Q01151 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD83Q01151 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD83Q01151 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms