Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 RALGDS-208ENST00000469972 5817 ntTSL 1 (best)15.58■□□□□ 0.082e-7■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 RALGDS-207ENST00000460587 674 ntTSL 314.25□□□□□ -0.132e-7■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 RALGDS-206ENST00000424572 926 ntTSL 510.13□□□□□ -0.792e-7■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.842e-6■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.052e-6■■■□□ 16.4
GTF2F1P35269 TTYH3-206ENST00000477439 731 ntTSL 217.95■□□□□ 0.462e-6■■■□□ 16.3
GTF2F1P35269 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.791e-6■■■□□ 16.3
GTF2F1P35269 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.453e-7■■■□□ 16.3
GTF2F1P35269 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.773e-7■■■□□ 16.3
GTF2F1P35269 AC073610.3-201ENST00000398092 939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.871e-10■■■□□ 16.3
GTF2F1P35269 BCAT2-211ENST00000601496 589 ntTSL 413.22□□□□□ -0.291e-6■■■□□ 16.3
GTF2F1P35269 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.73e-16■■■□□ 16.3
GTF2F1P35269 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.93e-16■■■□□ 16.3
GTF2F1P35269 AMD1-202ENST00000368877 1605 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.732e-6■■■□□ 16.3
GTF2F1P35269 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.032e-6■■■□□ 16.3
GTF2F1P35269 AMD1-205ENST00000451850 3121 ntTSL 1 (best)8.12□□□□□ -1.112e-6■■■□□ 16.3
GTF2F1P35269 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.172e-6■■■□□ 16.3
GTF2F1P35269 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.045e-7■■■□□ 16.3
GTF2F1P35269 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.923e-6■■■□□ 16.3
GTF2F1P35269 TMEM45B-204ENST00000527754 888 ntTSL 58.28□□□□□ -1.083e-6■■■□□ 16.3
GTF2F1P35269 TMEM45B-203ENST00000525709 247 ntTSL 57.94□□□□□ -1.143e-6■■■□□ 16.3
GTF2F1P35269 TMEM45B-205ENST00000529381 515 ntTSL 27.49□□□□□ -1.213e-6■■■□□ 16.3
GTF2F1P35269 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.428e-8■■■□□ 16.3
GTF2F1P35269 SLC2A1-206ENST00000625233 1031 ntTSL 219.89■□□□□ 0.773e-6■■■□□ 16.3
GTF2F1P35269 SLC2A1-202ENST00000415851 578 ntTSL 219.73■□□□□ 0.753e-6■■■□□ 16.3
GTF2F1P35269 SLC2A1-208ENST00000630287 2398 ntTSL 517.94■□□□□ 0.463e-6■■■□□ 16.3
GTF2F1P35269 SLC2A1-201ENST00000372500 533 ntTSL 317.74■□□□□ 0.433e-6■■■□□ 16.3
GTF2F1P35269 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.13e-6■■■□□ 16.3
GTF2F1P35269 FGFR4-216ENST00000514472 552 ntTSL 425.27■■□□□ 1.642e-17■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 FGFR4-209ENST00000507708 476 ntTSL 323.2■■□□□ 1.32e-17■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 FGFR4-212ENST00000510911 709 ntTSL 423.2■■□□□ 1.32e-17■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 FGFR4-214ENST00000513166 594 ntTSL 423.08■■□□□ 1.292e-17■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 FGFR4-204ENST00000426612 712 ntTSL 1 (best)22.51■■□□□ 1.192e-17■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 FGFR4-211ENST00000509511 1341 ntTSL 1 (best)21.34■■□□□ 1.012e-17■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 FGFR4-208ENST00000503708 770 ntTSL 421.15■□□□□ 0.982e-17■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.892e-17■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.862e-17■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.792e-17■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.692e-17■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 FGFR4-205ENST00000430285 713 ntTSL 1 (best)19.15■□□□□ 0.662e-17■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 LRRC8D-206ENST00000527156 922 ntTSL 213.11□□□□□ -0.313e-8■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.751e-6■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 PPP2R3B-203ENST00000445792 1998 ntTSL 229.92■■■□□ 2.384e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.814e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.514e-10■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.454e-10■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.444e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.434e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 PPP2R3B-201ENST00000381625 782 ntTSL 523.04■■□□□ 1.284e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 USF2-216ENST00000607959 1920 ntTSL 523.03■■□□□ 1.284e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.14e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 HDGFL2-207ENST00000615225 3100 ntTSL 521.83■■□□□ 1.084e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.054e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.014e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.994e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.974e-10■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 C1RL-203ENST00000534950 582 ntTSL 320.76■□□□□ 0.914e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.84e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 MICAL3-205ENST00000424046 542 ntTSL 419.65■□□□□ 0.744e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 USF2-213ENST00000600341 1392 ntTSL 219.49■□□□□ 0.714e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.684e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 USF2-211ENST00000599471 1173 ntTSL 319■□□□□ 0.634e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.584e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 USF2-208ENST00000596380 550 ntTSL 318.03■□□□□ 0.484e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.354e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.294e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.178e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.114e-10■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 COMT-211ENST00000493893 354 ntTSL 315.54■□□□□ 0.084e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 TRIM25-207ENST00000573108 952 ntTSL 313.84□□□□□ -0.194e-13■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 MICAL3-210ENST00000495076 5113 ntTSL 513.09□□□□□ -0.314e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 OGDH-205ENST00000444676 3309 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.334e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 OGDH-203ENST00000439616 2962 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.334e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 C1RL-208ENST00000543933 592 ntTSL 512.93□□□□□ -0.344e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 UBE3C-203ENST00000430750 448 ntTSL 412.88□□□□□ -0.354e-10■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 C1RL-204ENST00000534969 532 ntTSL 312.34□□□□□ -0.434e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 C1RL-205ENST00000537833 561 ntTSL 312.34□□□□□ -0.434e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 OGDH-207ENST00000449767 3479 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.484e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 OGDH-206ENST00000447398 3474 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.494e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 OGDH-201ENST00000222673 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.584e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 PPM1F-206ENST00000484588 348 ntTSL 510.88□□□□□ -0.674e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 OGDH-210ENST00000631326 4116 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.754e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 USF2-212ENST00000599625 446 ntTSL 210.34□□□□□ -0.754e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 EP400-204ENST00000389561 12317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.794e-10■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 EP400-205ENST00000389562 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.84e-10■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 OGDH-202ENST00000419661 789 ntTSL 59.85□□□□□ -0.834e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 PRMT5-218ENST00000555454 771 ntTSL 59.05□□□□□ -0.964e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 LRRC8D-204ENST00000441269 905 ntTSL 38.05□□□□□ -1.124e-10■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 USF2-209ENST00000597671 464 ntTSL 57.69□□□□□ -1.184e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.344e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 PSMB7-206ENST00000498485 967 ntTSL 516.26■□□□□ 0.194e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 PSMB7-201ENST00000259457 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.64e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 SMPD4P1-203ENST00000443839 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.788e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.482e-7■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.076e-8■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 PTPRG-205ENST00000475527 2694 ntTSL 524.28■■□□□ 1.483e-6■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 PTPRG-207ENST00000495879 3011 ntTSL 1 (best)22.22■■□□□ 1.153e-6■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 MICALL2-209ENST00000479007 1855 ntTSL 221.7■■□□□ 1.068e-9■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 MICALL2-215ENST00000496184 2722 ntTSL 220.16■□□□□ 0.828e-9■■■□□ 16.2
GTF2F1P35269 MICALL2-205ENST00000467783 639 ntTSL 319.39■□□□□ 0.698e-9■■■□□ 16.2
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 299.2 ms