Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGA3P0DJD8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms