Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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TAF11Q15544 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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TAF11Q15544 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TAF11Q15544 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms