Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF3P57682 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF3P57682 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLF3P57682 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLF3P57682 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLF3P57682 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLF3P57682 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KLF3P57682 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KLF3P57682 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms