Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AQP4P55087 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AQP4P55087 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AQP4P55087 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AQP4P55087 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AQP4P55087 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AQP4P55087 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AQP4P55087 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AQP4P55087 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AQP4P55087 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AQP4P55087 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AQP4P55087 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AQP4P55087 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AQP4P55087 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AQP4P55087 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AQP4P55087 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AQP4P55087 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AQP4P55087 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AQP4P55087 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AQP4P55087 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AQP4P55087 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AQP4P55087 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AQP4P55087 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AQP4P55087 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AQP4P55087 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AQP4P55087 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AQP4P55087 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AQP4P55087 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AQP4P55087 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AQP4P55087 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AQP4P55087 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AQP4P55087 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AQP4P55087 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AQP4P55087 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AQP4P55087 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AQP4P55087 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AQP4P55087 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AQP4P55087 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AQP4P55087 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AQP4P55087 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AQP4P55087 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AQP4P55087 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AQP4P55087 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AQP4P55087 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AQP4P55087 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AQP4P55087 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AQP4P55087 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AQP4P55087 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AQP4P55087 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AQP4P55087 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AQP4P55087 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AQP4P55087 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AQP4P55087 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms