Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPAN4O14817 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TSPAN4O14817 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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TSPAN4O14817 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TSPAN4O14817 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TSPAN4O14817 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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TSPAN4O14817 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TSPAN4O14817 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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