Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TSPAN4O14817 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TSPAN4O14817 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TSPAN4O14817 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSPAN4O14817 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSPAN4O14817 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSPAN4O14817 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSPAN4O14817 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSPAN4O14817 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSPAN4O14817 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSPAN4O14817 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSPAN4O14817 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSPAN4O14817 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TSPAN4O14817 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSPAN4O14817 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSPAN4O14817 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TSPAN4O14817 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSPAN4O14817 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSPAN4O14817 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSPAN4O14817 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSPAN4O14817 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TSPAN4O14817 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSPAN4O14817 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSPAN4O14817 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TSPAN4O14817 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN4O14817 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN4O14817 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN4O14817 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN4O14817 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSPAN4O14817 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN4O14817 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSPAN4O14817 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSPAN4O14817 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN4O14817 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN4O14817 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN4O14817 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN4O14817 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TSPAN4O14817 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN4O14817 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN4O14817 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN4O14817 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN4O14817 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN4O14817 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN4O14817 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN4O14817 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN4O14817 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN4O14817 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN4O14817 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN4O14817 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN4O14817 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TSPAN4O14817 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TSPAN4O14817 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TSPAN4O14817 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TSPAN4O14817 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TSPAN4O14817 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSPAN4O14817 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSPAN4O14817 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSPAN4O14817 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN4O14817 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPAN4O14817 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSPAN4O14817 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN4O14817 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN4O14817 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN4O14817 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN4O14817 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN4O14817 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN4O14817 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN4O14817 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN4O14817 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN4O14817 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN4O14817 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN4O14817 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN4O14817 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN4O14817 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN4O14817 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN4O14817 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN4O14817 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN4O14817 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN4O14817 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN4O14817 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN4O14817 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN4O14817 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN4O14817 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN4O14817 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN4O14817 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN4O14817 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN4O14817 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN4O14817 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN4O14817 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN4O14817 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN4O14817 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN4O14817 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSPAN4O14817 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN4O14817 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN4O14817 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN4O14817 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN4O14817 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSPAN4O14817 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSPAN4O14817 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TSPAN4O14817 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms