Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LINC00208Q96KT6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms