Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 TRAP1-215ENST00000576106 555 ntTSL 422.79■■□□□ 1.245e-7■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 TRAP1-203ENST00000570403 521 ntTSL 422.68■■□□□ 1.225e-7■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 TRAP1-205ENST00000571011 480 ntTSL 521.57■■□□□ 1.045e-7■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.045e-7■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 TRAP1-211ENST00000574941 558 ntTSL 419.32■□□□□ 0.685e-7■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.425e-7■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.269e-7■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SNHG17-207ENST00000449469 2138 ntTSL 216■□□□□ 0.159e-7■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.159e-7■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SNHG17-202ENST00000414142 2102 ntTSL 212.77□□□□□ -0.369e-7■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SNHG17-204ENST00000423536 517 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.019e-7■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.152e-9■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.22e-9■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.312e-9■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 MYADM-204ENST00000391770 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.522e-9■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 ZNF146-202ENST00000456324 3780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.921e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.511e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.832e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.582e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 GLCCI1-211ENST00000492797 495 ntTSL 213.1□□□□□ -0.312e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 GLCCI1-205ENST00000460897 412 ntTSL 210.35□□□□□ -0.752e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 HERPUD1-216ENST00000568814 509 ntTSL 29.75□□□□□ -0.853e-7■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 HERPUD1-208ENST00000563911 844 ntTSL 36.92□□□□□ -1.33e-7■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 HERPUD1-213ENST00000568358 751 ntTSL 54.73□□□□□ -1.653e-7■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SF1-214ENST00000477596 802 ntTSL 222.11■■□□□ 1.131e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.11e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.75■□□□□ 0.911e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.751e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.561e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 EP400NL-201ENST00000332441 2741 ntTSL 218.45■□□□□ 0.541e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 EP400NL-209ENST00000488030 1366 ntTSL 217.65■□□□□ 0.421e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.351e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.351e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SNAP29-203ENST00000490458 972 ntTSL 216.96■□□□□ 0.311e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.291e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.261e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 TUBGCP6-203ENST00000434349 830 ntTSL 516.19■□□□□ 0.181e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 TRAPPC11-204ENST00000505676 2244 ntTSL 1 (best)16.16■□□□□ 0.181e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.041e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 PPP1R7-220ENST00000498170 561 ntTSL 214.52□□□□□ -0.091e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 PPP1R7-211ENST00000438799 976 ntTSL 1 (best)14.27□□□□□ -0.131e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.151e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 PPP1R7-212ENST00000439916 583 ntTSL 314□□□□□ -0.171e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 PPP1R7-210ENST00000427172 421 ntTSL 313.97□□□□□ -0.171e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SF1-211ENST00000448404 2778 ntTSL 1 (best)13.97□□□□□ -0.171e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 PPP1R7-215ENST00000473017 583 ntTSL 313.75□□□□□ -0.211e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.231e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.251e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.281e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.281e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.311e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SF1-216ENST00000486867 875 ntTSL 312.92□□□□□ -0.341e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SF1-210ENST00000443908 767 ntTSL 312.91□□□□□ -0.341e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SF1-206ENST00000413725 843 ntTSL 212.69□□□□□ -0.381e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 PPP1R7-219ENST00000493374 560 ntTSL 312.62□□□□□ -0.391e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 DGCR2-207ENST00000608548 518 ntTSL 212.54□□□□□ -0.41e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SF1-204ENST00000377390 3470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.551e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 PPP1R7-206ENST00000406106 965 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.551e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 DGCR2-204ENST00000473832 606 ntTSL 510.8□□□□□ -0.681e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 EP400NL-208ENST00000475841 7090 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.791e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 PPP1R7-213ENST00000450367 1030 ntTSL 510.09□□□□□ -0.791e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 ZNF195-219ENST00000528636 542 ntTSL 49.9□□□□□ -0.821e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 PPP1R7-214ENST00000467159 572 ntTSL 39.54□□□□□ -0.881e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 FAR2P4-201ENST00000416266 2210 ntTSL 28.88□□□□□ -0.991e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 PPP1R7-209ENST00000423280 959 ntTSL 28.84□□□□□ -0.991e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 PPP1R7-217ENST00000485630 828 ntTSL 38.17□□□□□ -1.11e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 ZNF148-202ENST00000465763 566 ntTSL 47.98□□□□□ -1.131e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 PPP1R7-204ENST00000402734 883 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.221e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.321e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.381e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SNAP29-202ENST00000439214 681 ntTSL 36.34□□□□□ -1.391e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.41e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 AC015574.1-203ENST00000614344 498 ntTSL 55.81□□□□□ -1.481e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 KSR1-208ENST00000579309 343 ntTSL 55.8□□□□□ -1.481e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 AC015574.1-204ENST00000612595 512 ntTSL 55.2□□□□□ -1.581e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SSBP2-203ENST00000504174 632 ntTSL 523.59■■□□□ 1.372e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.522e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SSBP2-208ENST00000507655 845 ntTSL 517.86■□□□□ 0.452e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SSBP2-207ENST00000507472 582 ntTSL 316.16■□□□□ 0.182e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.036e-9■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.13e-8■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SSBP2-215ENST00000512098 566 ntTSL 513.75□□□□□ -0.212e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.252e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 NUP93-220ENST00000569842 2834 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.533e-8■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SSBP2-219ENST00000515395 1398 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.82e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SSBP2-201ENST00000320672 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.022e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SSBP2-205ENST00000505980 1521 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.092e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 NUP93-210ENST00000564887 2875 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.13e-8■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SSBP2-212ENST00000509053 1534 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.142e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.293e-8■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 SSBP2-211ENST00000509013 709 ntTSL 56.3□□□□□ -1.42e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.082e-6■■□□□ 12.3
TARDBPQ13148 B2M-210ENST00000560681 572 ntTSL 415.83■□□□□ 0.124e-18■■□□□ 12.2
TARDBPQ13148 B2M-207ENST00000559907 499 ntTSL 314.08□□□□□ -0.164e-18■■□□□ 12.2
TARDBPQ13148 B2M-202ENST00000544417 933 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.534e-18■■□□□ 12.2
TARDBPQ13148 B2M-208ENST00000559916 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.764e-18■■□□□ 12.2
TARDBPQ13148 B2M-204ENST00000558401 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.794e-18■■□□□ 12.2
TARDBPQ13148 B2M-206ENST00000559720 1220 ntTSL 59.59□□□□□ -0.874e-18■■□□□ 12.2
TARDBPQ13148 B2M-212ENST00000561424 604 ntTSL 39.59□□□□□ -0.874e-18■■□□□ 12.2
TARDBPQ13148 B2M-203ENST00000557901 407 ntTSL 1 (best)8.09□□□□□ -1.114e-18■■□□□ 12.2
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