Protein–RNA interactions for Protein: P30613

PKLR, Pyruvate kinase PKLR, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKLRP30613 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKLRP30613 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKLRP30613 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKLRP30613 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKLRP30613 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PKLRP30613 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKLRP30613 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKLRP30613 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKLRP30613 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKLRP30613 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKLRP30613 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKLRP30613 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKLRP30613 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PKLRP30613 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKLRP30613 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKLRP30613 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKLRP30613 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKLRP30613 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms