Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NR2C1P13056 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms