Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYNGR3O43761 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms