Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N3

CLCA3P, Calcium-activated chloride channel regulator family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA3PQ9Y6N3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCA3PQ9Y6N3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCA3PQ9Y6N3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCA3PQ9Y6N3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLCA3PQ9Y6N3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLCA3PQ9Y6N3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLCA3PQ9Y6N3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLCA3PQ9Y6N3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLCA3PQ9Y6N3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLCA3PQ9Y6N3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLCA3PQ9Y6N3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCA3PQ9Y6N3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCA3PQ9Y6N3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCA3PQ9Y6N3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCA3PQ9Y6N3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLCA3PQ9Y6N3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCA3PQ9Y6N3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCA3PQ9Y6N3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCA3PQ9Y6N3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLCA3PQ9Y6N3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLCA3PQ9Y6N3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLCA3PQ9Y6N3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCA3PQ9Y6N3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCA3PQ9Y6N3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCA3PQ9Y6N3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCA3PQ9Y6N3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLCA3PQ9Y6N3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLCA3PQ9Y6N3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLCA3PQ9Y6N3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms