Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAI2Q9Y5P3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAI2Q9Y5P3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RAI2Q9Y5P3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAI2Q9Y5P3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAI2Q9Y5P3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAI2Q9Y5P3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAI2Q9Y5P3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RAI2Q9Y5P3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAI2Q9Y5P3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAI2Q9Y5P3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAI2Q9Y5P3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAI2Q9Y5P3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RAI2Q9Y5P3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAI2Q9Y5P3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAI2Q9Y5P3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAI2Q9Y5P3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RAI2Q9Y5P3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RAI2Q9Y5P3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAI2Q9Y5P3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAI2Q9Y5P3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAI2Q9Y5P3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAI2Q9Y5P3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAI2Q9Y5P3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAI2Q9Y5P3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAI2Q9Y5P3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RAI2Q9Y5P3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAI2Q9Y5P3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAI2Q9Y5P3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAI2Q9Y5P3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAI2Q9Y5P3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAI2Q9Y5P3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAI2Q9Y5P3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAI2Q9Y5P3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAI2Q9Y5P3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAI2Q9Y5P3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAI2Q9Y5P3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAI2Q9Y5P3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAI2Q9Y5P3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAI2Q9Y5P3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAI2Q9Y5P3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAI2Q9Y5P3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAI2Q9Y5P3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAI2Q9Y5P3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RAI2Q9Y5P3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAI2Q9Y5P3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAI2Q9Y5P3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAI2Q9Y5P3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RAI2Q9Y5P3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAI2Q9Y5P3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAI2Q9Y5P3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAI2Q9Y5P3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAI2Q9Y5P3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1695.4 ms