Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y277

VDAC3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC3Q9Y277 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VDAC3Q9Y277 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VDAC3Q9Y277 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VDAC3Q9Y277 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VDAC3Q9Y277 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VDAC3Q9Y277 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VDAC3Q9Y277 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VDAC3Q9Y277 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VDAC3Q9Y277 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VDAC3Q9Y277 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VDAC3Q9Y277 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VDAC3Q9Y277 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VDAC3Q9Y277 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VDAC3Q9Y277 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VDAC3Q9Y277 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VDAC3Q9Y277 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VDAC3Q9Y277 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VDAC3Q9Y277 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VDAC3Q9Y277 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VDAC3Q9Y277 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VDAC3Q9Y277 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VDAC3Q9Y277 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VDAC3Q9Y277 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VDAC3Q9Y277 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VDAC3Q9Y277 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VDAC3Q9Y277 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VDAC3Q9Y277 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VDAC3Q9Y277 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VDAC3Q9Y277 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VDAC3Q9Y277 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms