Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ35

SRRM2, Serine/arginine repetitive matrix protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM2Q9UQ35 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SRRM2Q9UQ35 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRRM2Q9UQ35 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms