Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYNRGQ9UMZ2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYNRGQ9UMZ2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYNRGQ9UMZ2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SYNRGQ9UMZ2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNRGQ9UMZ2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNRGQ9UMZ2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNRGQ9UMZ2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYNRGQ9UMZ2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNRGQ9UMZ2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNRGQ9UMZ2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNRGQ9UMZ2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYNRGQ9UMZ2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms