Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH22Q9UJ99 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH22Q9UJ99 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH22Q9UJ99 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH22Q9UJ99 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH22Q9UJ99 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH22Q9UJ99 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH22Q9UJ99 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH22Q9UJ99 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH22Q9UJ99 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH22Q9UJ99 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH22Q9UJ99 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDH22Q9UJ99 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDH22Q9UJ99 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDH22Q9UJ99 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH22Q9UJ99 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH22Q9UJ99 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH22Q9UJ99 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH22Q9UJ99 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH22Q9UJ99 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH22Q9UJ99 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH22Q9UJ99 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH22Q9UJ99 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH22Q9UJ99 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH22Q9UJ99 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH22Q9UJ99 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH22Q9UJ99 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH22Q9UJ99 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH22Q9UJ99 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH22Q9UJ99 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH22Q9UJ99 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH22Q9UJ99 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms