Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCSK1NQ9UHG2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCSK1NQ9UHG2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCSK1NQ9UHG2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCSK1NQ9UHG2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCSK1NQ9UHG2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCSK1NQ9UHG2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCSK1NQ9UHG2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCSK1NQ9UHG2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCSK1NQ9UHG2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCSK1NQ9UHG2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCSK1NQ9UHG2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCSK1NQ9UHG2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCSK1NQ9UHG2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCSK1NQ9UHG2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCSK1NQ9UHG2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCSK1NQ9UHG2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PCSK1NQ9UHG2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCSK1NQ9UHG2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCSK1NQ9UHG2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCSK1NQ9UHG2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCSK1NQ9UHG2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCSK1NQ9UHG2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCSK1NQ9UHG2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCSK1NQ9UHG2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCSK1NQ9UHG2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCSK1NQ9UHG2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCSK1NQ9UHG2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCSK1NQ9UHG2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCSK1NQ9UHG2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCSK1NQ9UHG2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCSK1NQ9UHG2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PCSK1NQ9UHG2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms