Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PCSK1NQ9UHG2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PCSK1NQ9UHG2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
PCSK1NQ9UHG2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PCSK1NQ9UHG2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PCSK1NQ9UHG2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PCSK1NQ9UHG2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PCSK1NQ9UHG2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PCSK1NQ9UHG2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PCSK1NQ9UHG2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PCSK1NQ9UHG2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PCSK1NQ9UHG2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PCSK1NQ9UHG2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.93
PCSK1NQ9UHG2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PCSK1NQ9UHG2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PCSK1NQ9UHG2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PCSK1NQ9UHG2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PCSK1NQ9UHG2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PCSK1NQ9UHG2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PCSK1NQ9UHG2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PCSK1NQ9UHG2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
PCSK1NQ9UHG2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PCSK1NQ9UHG2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PCSK1NQ9UHG2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PCSK1NQ9UHG2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PCSK1NQ9UHG2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PCSK1NQ9UHG2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PCSK1NQ9UHG2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PCSK1NQ9UHG2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PCSK1NQ9UHG2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PCSK1NQ9UHG2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PCSK1NQ9UHG2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PCSK1NQ9UHG2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PCSK1NQ9UHG2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PCSK1NQ9UHG2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PCSK1NQ9UHG2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PCSK1NQ9UHG2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PCSK1NQ9UHG2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PCSK1NQ9UHG2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PCSK1NQ9UHG2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PCSK1NQ9UHG2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PCSK1NQ9UHG2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
PCSK1NQ9UHG2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PCSK1NQ9UHG2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PCSK1NQ9UHG2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PCSK1NQ9UHG2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PCSK1NQ9UHG2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PCSK1NQ9UHG2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PCSK1NQ9UHG2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PCSK1NQ9UHG2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PCSK1NQ9UHG2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PCSK1NQ9UHG2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
PCSK1NQ9UHG2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PCSK1NQ9UHG2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PCSK1NQ9UHG2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PCSK1NQ9UHG2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PCSK1NQ9UHG2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PCSK1NQ9UHG2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PCSK1NQ9UHG2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PCSK1NQ9UHG2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PCSK1NQ9UHG2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PCSK1NQ9UHG2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PCSK1NQ9UHG2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PCSK1NQ9UHG2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PCSK1NQ9UHG2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PCSK1NQ9UHG2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PCSK1NQ9UHG2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PCSK1NQ9UHG2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PCSK1NQ9UHG2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PCSK1NQ9UHG2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PCSK1NQ9UHG2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PCSK1NQ9UHG2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PCSK1NQ9UHG2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PCSK1NQ9UHG2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PCSK1NQ9UHG2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PCSK1NQ9UHG2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PCSK1NQ9UHG2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PCSK1NQ9UHG2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PCSK1NQ9UHG2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PCSK1NQ9UHG2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PCSK1NQ9UHG2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PCSK1NQ9UHG2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PCSK1NQ9UHG2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PCSK1NQ9UHG2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PCSK1NQ9UHG2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PCSK1NQ9UHG2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PCSK1NQ9UHG2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PCSK1NQ9UHG2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PCSK1NQ9UHG2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
PCSK1NQ9UHG2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PCSK1NQ9UHG2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PCSK1NQ9UHG2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PCSK1NQ9UHG2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PCSK1NQ9UHG2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PCSK1NQ9UHG2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCSK1NQ9UHG2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PCSK1NQ9UHG2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PCSK1NQ9UHG2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PCSK1NQ9UHG2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PCSK1NQ9UHG2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms