Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EBF1Q9UH73 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EBF1Q9UH73 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EBF1Q9UH73 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EBF1Q9UH73 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EBF1Q9UH73 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EBF1Q9UH73 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EBF1Q9UH73 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms