Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM4

OPTC, Opticin, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTCQ9UBM4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
OPTCQ9UBM4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
OPTCQ9UBM4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
OPTCQ9UBM4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OPTCQ9UBM4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms