Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HCN3Q9P1Z3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HCN3Q9P1Z3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HCN3Q9P1Z3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCN3Q9P1Z3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCN3Q9P1Z3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCN3Q9P1Z3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HCN3Q9P1Z3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HCN3Q9P1Z3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HCN3Q9P1Z3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms