Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY26

SLC39A1, Zinc transporter ZIP1, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A1Q9NY26 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC39A1Q9NY26 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC39A1Q9NY26 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC39A1Q9NY26 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC39A1Q9NY26 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms