Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH1

DNAJC11, DnaJ homolog subfamily C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC11Q9NVH1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAJC11Q9NVH1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DNAJC11Q9NVH1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNAJC11Q9NVH1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms